Felizmente, ainda não tive este problema, mas penso que, se parecer que funciona bem, então pode continuar a utilizá-lo. Depois de um pouco de pesquisa também encontrei isto :
Coloquei acidentalmente algo de metal no microondas do meu amigo há cerca de 3 anos atrás. O metal estava coberto de plástico, por isso não me apercebi do que estava a fazer. O cheiro era muito mau, mas até hoje o microondas funciona.
O microondas da minha mãe estava a ter um problema onde não se desligava. No outro dia, ela estava ao telefone e esqueceu-se disso, e queimou algo no microondas. Agora nem sequer aquece água. Então, ela teve que jogar o dela fora.
Acho que o microondas está bem se ainda funcionar.
E um semelhante aqui :
O metal não vai machucar a comida de forma alguma, a comida deve ficar bem. Desde que o microondas pareça funcionar correctamente, também deve estar bem. Já deixei acidentalmente utensílios no microondas antes e o aparelho não sofreu danos. Os danos são apenas uma possibilidade, não uma ocorrência definitiva.
Alguns metais são mesmo destinados a serem colocados no microondas, depende do tipo e da forma. O meu micro-ondas, por exemplo, veio com um suporte metálico que desliza para o centro. Penso que depende em parte de haver ou não bordas planas no metal, que podem causar faíscas.
Resumindo, você está bem. Só não faça com que deixar o metal no microondas seja um hábito. Tecnicamente, pode provocar um curto-circuito, incendiar-se ou começar a agir de outra forma. Mas você saberá se isso acontecer.
Penso que outra boa ideia seria ligar ao fabricante e perguntar-lhe se quer verificar duas vezes.