Contra as respostas anteriores: ao usar fresh tomatoes, uma chave para evitar molhos de tomate aquosos (e molhos à base de muitos outros tipos de puré de legumes) é aproximar rapidamente de uma fervura no início.
Os tomates frescos contêm enzimas naturais que quebrarão a pectina e outros componentes espessantes. Aquecendo rapidamente a uma fervura (ou quase) no início, irá desactivar estas enzimas. Em seguida, reduzir para uma temperatura baixa para preservar os componentes do sabor durante o resto da cozedura. Se você não fizer este primeiro passo, o molho ficará aguado e você passará muito mais tempo engrossando-o novamente por redução (ou outros meios).
Para mais detalhes veja Kenji Lopez-Alt’s P&R aqui (onde ele cita os conselhos semelhantes de Harold McGee sobre o mesmo tópico).
(Note que este conselho só se aplica ao molho feito de tomate fresco. As conservas de tomate já foram aquecidas no processo de enlatamento, pelo que as enzimas já devem ser desactivadas. As conservas de tomate em lata podem ser lentamente fervidas).