Se está interessado na teoria, a resposta é sim, há uma mudança. Se está interessado em fazer dieta, a resposta continua a ser sim, mas é bastante irrelevante para si.
Existem dois tipos de reacções de escurecimento, Maillard e caramelização. Ambas começam com moléculas altamente complicadas e terminam com diferentes tipos de moléculas altamente complicadas. Para uma resposta muito precisa à sua pergunta, seria necessário saber todas as reacções químicas possíveis que aí ocorrem, a energia retida nos precursores e nas moléculas resultantes, e se essa energia é acessível ao corpo humano (por exemplo, há muita energia na gasolina crua, mas o seu corpo não a pode extrair se por acaso a comer). Como estas reacções não foram estudadas com este nível de detalhe, não é possível dar uma resposta realmente precisa.
Por outro lado, a tendência seria para que as calorias (pelo menos as digeríveis) caíssem um pouco. Primeiro, as calorias de aminoácidos e hidratos de carbono (que são os inputs para o escurecimento) são digeríveis; alguns dos produtos de reacção podem ser digeríveis, mas nem todos o serão. Em segundo lugar, algumas das calorias desaparecerão literalmente no ar - porque alguns dos produtos destas reacções são voláteis.
Mas se estiver à espera de reduzir a sua ingestão de calorias alimentares comendo pão tostado, provavelmente não fará qualquer diferença. Em primeiro lugar, os efeitos de redução calórica apenas ocorrerão para uma pequena parte das moléculas envolvidas. Em segundo lugar, e mais importante: mesmo que ocorra para todas as moléculas envolvidas, o escurecimento só acontece à superfície (teoricamente, pode acontecer também no interior, se o aquecer na gama dos 154ºC - 190ºC. Praticamente, se o estiver a fazer, ninguém vai querer comer esse alimento). A superfície é bastante pequena por oposição ao resto - vamos assumir uma fatia com 1 cm de espessura e um acastanhamento generoso de 0,5 milímetros de profundidade. (sei que a parte que fica dura é mais espessa, mas não fica mais acastanhada). Vou ignorar o alargamento da superfície causado por bolhas fermentadas no miolo (porque tenho medo de acabar com uma superfície fractal infinita :) ) e depois temos ~10% da fatia dourada. Como disse, não há qualquer hipótese de todas as calorias nesta parte desaparecerem completamente, e duvido que a redução seja realmente significativa. Mas mesmo que estivesse a um nível realmente elevado de 50%, só se consegue uma redução de 5% no total, ou 10 calorias por fatia de pão branco, menos para pães amigos da dieta (e este número é apenas um palpite inflacionado na melhor das hipóteses).